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title: "Extraction et préparation des données"
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author: "François Pelletier"
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date: "10 octobre 2015"
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output: html_document
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#Extraction et préparation des données du jeu «Tableau de bord de l’état de santé des projets en ressources informationnelles de l’administration publique»
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##Extraction des métadonnées
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```{r}
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library(XML)
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library(dplyr)
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source("FilterList.R")
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# Identifiant unique du jeu de données
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UUID = "c60b2248-0ca4-4b12-89d3-2f087a319bea"
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# URL pour récupérer les métadonnées
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urlRDF <- paste0("http://www.donnees.gouv.qc.ca/geonetwork/srv/eng/rdf.metadata.get?uuid=",UUID)
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# Document de métadonnées
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RDFdoc<- urlRDF %>%
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xmlTreeParse %>%
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xmlRoot
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```
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Quel est le contenu du fichier de métadonnées ?
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```{r}
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# Fréquence de chaque type de noeuds
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RDFdoc %>%
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names %>%
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table %>%
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as.data.frame %>%
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"colnames<-"(c("Type de noeud","Fréquence"))
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# Nombre de champs dans chaque noeud
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xmlSApply(RDFdoc, xmlSize)
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# Extraction à une profondeur de 1
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champs <- xmlSApply(RDFdoc, function(x) xmlSApply(x, xmlValue))
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# Je veux seulement les champs de type «Distribution»
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champsDistribution <- champs[names(champs) == "Distribution"]
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```
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Je veux extraire les noms des fichiers de données pour les télécharger
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```{r}
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datafileNames <- champsDistribution %>%
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lapply(function(x) as.character(x[x["format"]=="WWW:DOWNLOAD-1.0-ftp--downloadWWW:DOWNLOAD-1.0-ftp--download"])) %>%
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FilterList(function(x) !identical(character(0),x)) %>%
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as.data.frame %>% t
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datafileNames
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```
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Les fichiers actuels présentent des erreurs d'encodage qui devront être corrigées manuellement. Voir le courriel joint.
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```{r eval=FALSE}
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rawdata <- list()
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rawdata <- lapply(datafileNames[,1],read.csv2,header=FALSE,sep=";",encoding="utf-8",skip = 1)
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```
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Je télécharge donc les fichiers manuellement
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```{r eval=FALSE}
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lapply(datafileNames[,1], function (x) system2("wget", x))
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noms_fichiers_telecharges <- list.files(path = ".", pattern = ".csv")
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system("bash conversion_csv.sh")
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```
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Je les importe ensuite
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```{r}
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rawdata <- list()
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rawdata <-lapply(1:7,function(i) rawdata[[i]] <- read.csv2(paste0("tr_tableau_de_bord_",i,".csv"),
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header = TRUE,
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sep=";",
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encoding="utf-8",
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stringsAsFactors = FALSE,
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dec = ","))
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rawdata %>% lapply(names)
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```
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Je corrige les incohérences manuellement jusqu'à temps que je puisse faire la jointure des données
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```{r}
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rawdata[[4]]$Pourcentage_avancement[levels(rawdata[[4]]$Pourcentage_avancement) == "-"] <- NA
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rawdata[[4]]$Pourcentage_avancement <- as.integer(rawdata[[4]]$Pourcentage_avancement)
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rawdata[[1]]$Cote_de_coût <- as.numeric(rawdata[[1]]$Cote_de_coût)
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rawdata[[2]]$Cote_de_coût <- as.numeric(rawdata[[2]]$Cote_de_coût)
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rawdata[[3]]$Cote_de_coût <- as.numeric(rawdata[[3]]$Cote_de_coût)
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||
rawdata[[1]]$Variation_de_coût <- as.numeric(rawdata[[1]]$Variation_de_coût)
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rawdata[[2]]$Variation_de_coût <- as.numeric(rawdata[[2]]$Variation_de_coût)
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||
rawdata[[3]]$Variation_de_coût <- as.numeric(rawdata[[3]]$Variation_de_coût)
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||
rawdata[[1]]$Variation_écheancier <- as.numeric(rawdata[[1]]$Variation_écheancier)
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||
rawdata[[2]]$Variation_écheancier <- as.numeric(rawdata[[2]]$Variation_écheancier)
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||
rawdata[[3]]$Variation_écheancier <- as.numeric(rawdata[[3]]$Variation_écheancier)
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rawdata[[5]]$Montant_reel_depense <- gsub(",", ".", rawdata[[5]]$Montant_reel_depense)
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||
rawdata[[5]]$Montant_reel_depense <- gsub(" ", "", rawdata[[5]]$Montant_reel_depense)
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||
rawdata[[5]]$Montant_reel_depense <- as.numeric(rawdata[[5]]$Montant_reel_depense)
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||
rawdata[[5]]$Montant_reel_depense[105:450] <- rawdata[[5]]$Montant_reel_depense[105:450]*1000
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rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet <- gsub(",", ".", rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet)
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rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet <- gsub(" ", "", rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet)
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||
rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet <- as.numeric(rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet)
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||
rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet[105:450] <- rawdata[[5]]$Cout_estime_pour_completer_le_projet[105:450]*1000
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||
rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise <- gsub(",", ".", rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise)
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||
rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise <- gsub(" ", "", rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise)
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||
rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise <- as.numeric(rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise)
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rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise[105:450] <- rawdata[[5]]$Budget_autorise_revise[105:450]*1000
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rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial <- gsub(",", ".", rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial)
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rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial <- gsub(" ", "", rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial)
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rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial <- as.numeric(rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial)
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rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial[105:450] <- rawdata[[5]]$Budget_autorise_initial[105:450]*1000
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convertir.noms <- function(noms)
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{
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noms <- noms %>% iconv(to="ASCII//TRANSLIT") %>% tolower
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noms[noms=="date_de_fin_revise"] <- "date_de_fin_revisee"
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noms
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}
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for (i in 1:7)
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{
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names(rawdata[[i]]) <- convertir.noms(names(rawdata[[i]]))
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}
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```
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Jointure de tous les fichiers de données dans une même table
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```{r}
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rawdata2 <- dplyr::bind_rows(rawdata)
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```
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