199 lines
No EOL
5.8 KiB
Markdown
199 lines
No EOL
5.8 KiB
Markdown
---
|
|
author: François Pelletier
|
|
title: Les principes FAIR
|
|
date: 28 novembre 2023
|
|
---
|
|
|
|
# Les principes FAIR
|
|
|
|
## Objectif
|
|
|
|
Rendre les données de recherche réutilisables par les individus et les machines.
|
|
|
|
## Enjeux actuels avec les données
|
|
|
|
### Données massives
|
|
|
|
- Volume
|
|
- Variété
|
|
- Vélocité
|
|
- Véracité
|
|
- Valeur
|
|
|
|
|
|
|
|
### Complexité des données
|
|
|
|
- Multidisciplinaires
|
|
- Méthodes et instruments complexes
|
|
- Logiciels et matériel requis
|
|
- Environnement légal et éthique
|
|
|
|
### Trouver ce qui existe déjà
|
|
|
|
- Trouver un article: 🎯
|
|
- Télécharger l'article: 📚, 💸 ou 🐦⬛
|
|
- Trouver les données qui vont avec: 🧗
|
|
- Ouvrir les données: 🤡
|
|
|
|
### Déplacer et stocker les données
|
|
|
|
À l'Université Laval, nous avons:
|
|
|
|
- Médias physiques: Livres, Microfiches, VHS, Disques
|
|
- Serveurs: Sites web, FTP, GLOBUS, S3, GitLab, Subversion
|
|
- Logiciels partagés Microsoft 365: SharePoint, Teams, ...
|
|
|
|
## Que signifie FAIR ?
|
|
|
|
- **F**indable (découvrable)
|
|
- **A**ccessible (accessible)
|
|
- **I**nteroperable (interoperable)
|
|
- **R**eusable (réutilisable)
|
|
|
|
### Définitions formelles
|
|
|
|
- FAIR a été défini par Wilkinson, M. D. et al. (2016)
|
|
- Le concept d'Open Data est défini par l'Open Knowledge Foundation, via la Définition du Savoir Libre.
|
|
|
|
## Qu'est-ce qui est concerné ?
|
|
|
|
Tous les actifs numériques produits par des activités de recherche
|
|
|
|
- Données quantitatives et qualitatives
|
|
- Figures
|
|
- Multimédia
|
|
- Texte
|
|
- Code informatique
|
|
- Protocole de recherche
|
|
- Plans et instructions de fabrication
|
|
|
|
## Les 4 lettres
|
|
|
|
### **F**indable (découvrable)
|
|
|
|
- Identifiant unique
|
|
- DOI: Digital object identifier
|
|
- Pour des actifs numériques de recherche
|
|
- [DOI Handbook](https://doi.org/10.1000/182)
|
|
- URI: Uniform Resource Identifier:
|
|
- Pour tout ce qui est accessible sur le web
|
|
- Inclus tous les fichiers et pages web
|
|
- S'applique aussi à des concepts et des entités.
|
|
- Fondement du web sémantique (web 3.0)
|
|
- Métadonnées
|
|
- Plus elles sont détaillées, plus elles renseignent les moteurs de recherche
|
|
- [Schema.org](https://schema.org/): Guide de métadonnées et vocabulaires
|
|
- [Wikidata](https://www.wikidata.org/): Un exemple de structure
|
|
- [DataCite](https://schema.datacite.org/)
|
|
- Indexation
|
|
- Dépôts de données
|
|
- [Borealis](https://borealisdata.ca/)
|
|
- [Dataverse](https://dataverse.org/)
|
|
- Moteurs de recherche
|
|
- [Google Datasets](https://datasetsearch.research.google.com/)
|
|
|
|
### **A**ccessible (accessible)
|
|
|
|
- Métadonnées
|
|
- Normalisées
|
|
- Identifiant unique
|
|
- Licence d'utilisation
|
|
- [Open Database License](https://opendatacommons.org/licenses/odbl/)
|
|
- [Creative Commons License](https://creativecommons.org/share-your-work/cclicenses/)
|
|
- Protocole d'accès aux métadonnées
|
|
- Caractéristiques
|
|
- Libre: Aucune restriction d'usage
|
|
- Ouvert: Documenté
|
|
- Universel: Utilisable avec plusieurs médias
|
|
- Permission: Authentification et Autorisation
|
|
- Exemples: HTTPS, FTP, Courriel, Téléphone, Poste
|
|
- Indépendantes des données
|
|
- Si les données expirent ou on reçoit une demande de suppression
|
|
- Sensibilité des données (confidentiel)
|
|
|
|
### **I**nteroperable (interoperable)
|
|
|
|
- Représentation des connaissances
|
|
- Formalisé
|
|
- Accessible
|
|
- Partagé
|
|
- Applicables à plusieurs contextes
|
|
- Vocabulaire
|
|
- Ontologies
|
|
- [BioPortal](https://bioportal.bioontology.org/ontologies)
|
|
- [EU Semantic Interoperability Catalogue](https://joinup.ec.europa.eu/collection/eu-semantic-interoperability-catalogue)
|
|
- [Logiciel Protégé](https://protege.stanford.edu/)
|
|
- FAIR aussi
|
|
- Références
|
|
- Identifiants uniques
|
|
- Toile de données
|
|
- Linked Data <https://www.w3.org/DesignIssues/LinkedData.html>
|
|
- Concerne les données et les métadonnées
|
|
|
|
### **R**eusable (réutilisable)
|
|
|
|
- Description riche
|
|
- Source
|
|
- Références
|
|
- Lignage (qui, quand, comment, avec quoi)
|
|
- Code informatique
|
|
- Encodage
|
|
- Normes de pratique du domaine
|
|
- Schémas de métadonnées
|
|
|
|
## Pourquoi appliquer les principes FAIR
|
|
|
|
### Qualité
|
|
|
|
- Augmenter la qualité des données de recherche
|
|
- Données complètes
|
|
- Intégrité des données
|
|
- Sources vérifiables
|
|
- Éliminer la duplication
|
|
- Validité (domaines de valeurs)
|
|
- Temporalité (âge des données)
|
|
|
|
### Revalorisation
|
|
|
|
- Créer des collections de données de recherche
|
|
|
|
### Pérennité
|
|
|
|
- Assurer la pérennité des résultats de recherche et des publications.
|
|
- Reproductibilité
|
|
- Autonomie dans l'usage de données de recherche
|
|
|
|
### Méta-analyses
|
|
|
|
- L'interopérabilité permet de faire des méta-analyses sans devoir convertir les données dans d'autres formats ou trouver des équivalences de vocabulaire
|
|
|
|
### Cycle de vie
|
|
|
|
- Aider les chercheur.es à organiser leurs données tout au long du cycle de vie
|
|
- Gestion des consentements
|
|
- Facilite l'élaboration de plan de gestion de données
|
|
- Mise à jour des résultats
|
|
|
|
### Transparence
|
|
|
|
- Favoriser la reddition de compte et la demande de financement public
|
|
- Augmenter la valeur et l'impact à long terme de la recherche
|
|
- Réduire les rétractations
|
|
- Opinion publique
|
|
|
|
## Références
|
|
|
|
- Wilkinson, M. D. et al. The FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship. Sci. Data 3:160018 doi: <https://dx.doi.org/10.1038/sdata.2016.18> (2016).
|
|
- Open Knowledge Foundation. Définition du Savoir Libre. Version: 1.1 <https://opendefinition.org/od/1.1/fr/>
|
|
- Go FAIR. FAIR Principles
|
|
<https://www.go-fair.org/fair-principles/>
|
|
- OpenAIRE. How to make your data FAIR. <https://www.openaire.eu/how-to-make-your-data-fair>
|
|
|
|
## Licence
|
|
|
|
Les principes FAIR (c) par François Pelletier
|
|
|
|
Les principes FAIR est disponible sous la licence Creative Commons Attribution 4.0 International License.
|
|
|
|
Vous devriez avoir reçu une copie de la licence avec cette oeuvre. Sinon, voir <https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/>. |